原標(biāo)題：新冠病毒有“多長(zhǎng)”？ 上海疾控詳解：德爾塔變異株如何查“家譜”？

6日，記者從上海市疾控中心獲悉，此前其通報(bào)：上海市8月2日新增的1例新冠肺炎確診病例感染的新冠病毒基因測(cè)序結(jié)果顯示，屬于德爾塔（delta）變異株，與境外德爾塔變異株同源性較高?；蛲葱暂^高是什么意思？基因測(cè)序是如何發(fā)現(xiàn)病毒基因與境外變異株高度相似的？來(lái)看上海市疾控中心的解答。

新冠病毒就像一條手鏈，可以由不同的珠子串起來(lái)，手鏈上的每顆珠子都是具有特殊功能的基因。當(dāng)把珠子放大，就會(huì)發(fā)現(xiàn)每顆珠子都是由四種堿基緊密排列組成的。所以，基因測(cè)序就是先發(fā)現(xiàn)珠子，再放大看其中的堿基是怎么排列的；當(dāng)把堿基排列情況看清楚時(shí)，就可以完全測(cè)定出來(lái)新冠病毒的核酸序列。

新冠病毒這條“手鏈”的長(zhǎng)度為29903（約3萬(wàn)）個(gè)堿基。在以前技術(shù)不是那么發(fā)達(dá)的時(shí)候，技術(shù)人員測(cè)定整個(gè)基因組可能要耗費(fèi)數(shù)周甚至數(shù)月的時(shí)間。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展，憑借全基因組測(cè)序技術(shù)，可以一次性完成之前數(shù)月的工作。當(dāng)然，這項(xiàng)技術(shù)操作起來(lái)比較復(fù)雜，不僅僅需要在實(shí)驗(yàn)室里進(jìn)行，還需要高性能計(jì)算機(jī)，至少分析數(shù)小時(shí)才能完成。

測(cè)定出新冠病毒的序列后，就可以分型了。

還是拿手鏈打比方，通過(guò)對(duì)比不同“手鏈”的差異，我們可以將相似的“鏈子”歸到同一個(gè)“系列”，這個(gè)過(guò)程叫分型。

各種分型方法的原理是類似的，都是利用病毒傳播過(guò)程中核酸序列上特定位置的變化來(lái)進(jìn)行分型，這對(duì)防控工作十分重要，是明確病毒來(lái)源并調(diào)整防控策略的重要依據(jù)之一。

為什么能通過(guò)基因測(cè)序鎖定病毒來(lái)源

上海市疾控中心對(duì)上海市8月2日病例的呼吸道標(biāo)本開展了新冠病毒全基因組序列測(cè)定，結(jié)果顯示，雖然該病毒屬于德爾塔型，但它的變異情況和一株北美株高度相似，而與近期我國(guó)其他地區(qū)的病例感染的病毒變異不一樣。結(jié)合病例的工作性質(zhì)，因此推測(cè)此次本土病例感染來(lái)源很可能是國(guó)外而不是國(guó)內(nèi)其他地區(qū)。

病毒發(fā)生變異后，這些變異會(huì)遺傳給病毒的下一代并且不大可能返祖，也就是說(shuō)處在同一傳播鏈條上的病例帶有的病毒肯定會(huì)包含之前傳播者帶有的病毒的全部變異。因此，通過(guò)比較病毒變異是否一致，我們就可以判斷兩個(gè)病例之間是不是在同一傳播鏈上，一例一例比較后能精準(zhǔn)地推斷病毒的來(lái)源。

基因測(cè)序還有更多高大上的作用

科學(xué)家通過(guò)對(duì)病毒進(jìn)行全基因組測(cè)序，可以了解新冠病毒不同傳播階段的變異情況，由此推測(cè)病毒對(duì)人的感染力的變化情況。

還可以了解現(xiàn)在的核酸檢測(cè)診斷試劑是否有效，因?yàn)楹怂釞z測(cè)僅僅是檢測(cè)病毒核酸序列的一部分，如果被檢測(cè)的這部分序列發(fā)生改變，那么就需要對(duì)檢測(cè)試劑進(jìn)行改進(jìn)了。

另外，疫苗研發(fā)者可利用基因組測(cè)序技術(shù)觀察病毒變化情況，研究現(xiàn)有疫苗或正在研發(fā)的疫苗是否有效，從而對(duì)疫苗的研發(fā)策略進(jìn)行修改，讓疫苗更有針對(duì)性。（記者 王殿甲）